Para a Seleção de Projetos,  são considerados os seguintes critérios:

1. Produtos intensivos em tecnologia
Os produtos, processos ou serviços desenvolvidos pela empresa deverão ter significativo grau de inovação tecnológica.

2. Projeto viável
O projeto deverá demonstrar viabilidade técnica e mercadológica.

3. Retorno comercial
Os produtos ou processos a serem desenvolvidos deverão oferecer perspectiva de retorno comercial.

4. Qualificação do proponente e equipe
O currículo e o perfil do proponente e da equipe devem ser compatíveis com os objetivos da empresa e com os resultados pretendidos.

5. Autonomia da empresa
A empresa a ser formada deverá demonstrar que, após o período de incubação, terá condições de se manter de forma autônoma, transferindo-se da incubadora para uma outra sede.

6. Adequação aos objetivos da incubadora
O projeto deverá ser adequado aos objetivos do Programa SEBRAE e ser compatível com as condições existentes no local.

7. Produtos não-poluentes
Os produtos e processos desenvolvidos não poderão ser poluentes e deverão atender às normas e regulamentos.